臺灣民間對這次發(fā)生的事件非常氣憤，要求臺灣的外務(wù)機構進(jìn)行調說(shuō)明。新上任的“部長(cháng)”吳釗燮答復：“我們秉持勿枉勿縱的態(tài)度處理，日方若過(guò)度執法，我方當強烈抗議，若我方漁船有越界行為，政府也會(huì )加以處理。該船是否有越界作業(yè)行為，農委會(huì )漁業(yè)署刻正進(jìn)行查證，我方也已洽請日方提供具體事證。”

　  這番話(huà)的意思就是不采信臺灣漁船的話(huà)，他們在現場(chǎng)拍攝的影片，也不足為證，必須要聽(tīng)日本方面的說(shuō)詞。如果日本說(shuō)臺灣漁船越界了，臺灣當局就要對該漁船做出處罰！

　　 日本水產(chǎn)廳已經(jīng)派取締船朝著(zhù)臺灣漁船噴水、追逐意圖扣押，他們會(huì )說(shuō)該漁船沒(méi)有入侵日本海域，只是在鬧著(zhù)玩的？“東半球28號”的船長(cháng)船員等著(zhù)吧！媚日的綠色政權不久就要收拾你們了。

　  經(jīng)過(guò)幾天的調查，“漁業(yè)署”表示：“東半球28號”在2月28日至3月3日之間，以特定漁業(yè)的身份出航，由于該船漁業(yè)執照為延繩釣漁船，根據《延繩釣漁船赴臺日漁業(yè)協(xié)議適用海域作業(yè)管理辦法》的規定，延繩釣漁船未經(jīng)許可，不得赴臺日漁業(yè)協(xié)議海域作業(yè)。經(jīng)查，“東半球28號”3月1日至3月3日進(jìn)入臺日漁業(yè)協(xié)議海域內外作業(yè)并未經(jīng)過(guò)核準，已違法。

　  他們的調查結果是“東半球28號”進(jìn)入了“臺日漁業(yè)協(xié)議海域內外”，但該漁船未經(jīng)核準。臺灣漁船需要經(jīng)過(guò)誰(shuí)的核準，臺灣或日方的呢？難道說(shuō)臺灣漁船去那個(gè)所謂的“臺日漁業(yè)協(xié)議適用海域”，必須要到日本申請核準？或是日方可以隨時(shí)調閱臺方的數據，知道“東半球28號”未經(jīng)核準，就一路追殺過(guò)來(lái)？臺灣和日本訂下的什么不平等協(xié)議？