從路線(xiàn)方面，國民黨的理想信念模糊，缺乏一套有別于民進(jìn)黨且有感召力的話(huà)語(yǔ)體系和政策論述，路線(xiàn)主張不清晰、不明確，本土派“藍皮綠骨”，繼承了李登輝的路線(xiàn)，與民進(jìn)黨政治主張相近。非本土派繼承了傳統的國民黨路線(xiàn)，接受“九二共識”、堅持“中華民國”的“法統地位”。在黨主席的選舉中，圍繞路線(xiàn)問(wèn)題矛盾復雜、分歧嚴重、斗爭激烈，尤其是本土派更是將路線(xiàn)之爭作為權斗的工具，將原主席洪秀柱貼上“終極統一”的標簽，刻意攻擊、大肆唱衰，打壓洪的選情，加劇了黨的路線(xiàn)分歧與斗爭。國民黨“立院”黨團書(shū)記長(cháng)林為洲一針見(jiàn)血地指出，國民黨民調沒(méi)起色，關(guān)鍵在于黨內黨代表、中央委員、中常委等選舉內耗太久，讓各級民代疏于本業(yè)，選舉過(guò)程的負面形象更讓黨扣分。

　  困結整合艱困改革阻力大。激烈的權力斗爭及路線(xiàn)分歧，不易調和，使得黨的團結整合極其艱困，嚴重影響、削弱黨的整體競爭力、戰斗力，黨中央對全黨的凝聚力不足，洪秀柱擔任黨主席時(shí)被外界形容黨令出不了中央黨部；吳敦義接任后，黨內的矛盾斗爭依舊，舊的問(wèn)題沒(méi)能很好解決，新的矛盾又接踵而至，團結整合形勢復雜棘手，吳的表現不那么令人滿(mǎn)意，吳誓言振興國民黨、重返執政，卻沒(méi)有能夠很好地整合、團結全黨，個(gè)人形象、低迷氣勢無(wú)明顯改觀(guān)，9月民調反映，近60%的民眾不相信吳能帶領(lǐng)國民黨改革成功；中評智庫大數據中心報告顯示，吳的個(gè)人形象對青年世代仍缺乏吸引力。這些說(shuō)明吳上任后沒(méi)有展現出應有的組織領(lǐng)導和團結整合能力。

　  國民黨的衰敗，也使得黨內改革的呼聲高漲，特別是黨主席選舉，各候選人都提出自己的改革理念和主張，吳敦義上臺后，也提出一系列改革措施。然改革的動(dòng)力有余深度不足，阻力重重，對改革的方向、領(lǐng)域、內容分歧大，難以達成共識，矛盾復雜、斗爭激烈；世代斷層、青黃不接現象嚴重，新老交替成效不大，對年輕人缺乏吸引力；黨務(wù)改革雷聲大、雨點(diǎn)小，中央黨務(wù)結構和選前沒(méi)有太大區別；黨產(chǎn)包袱仍重，任人宰割；加之主席領(lǐng)導權威不足，領(lǐng)導人變動(dòng)頻繁，改革的連續性難以保證。這些都嚴重制約國民黨的發(fā)展。

　 被動(dòng)挨打斗爭策略薄弱。國民黨在野已經(jīng)一年多，雖一再表示要做一個(gè)合格的在野黨，卻遠遠沒(méi)有達到，在野斗爭經(jīng)驗和策略極其缺乏、薄弱，無(wú)法與過(guò)去在野的民進(jìn)黨相提并論，民進(jìn)黨在野時(shí)通過(guò)體制內的“合法”抗爭和體制外的強大社會(huì )運動(dòng)相結合，弄得國民黨焦頭爛額、極其被動(dòng)，施政舉步維艱。現今，國民黨在野一年多，與民進(jìn)黨的身份來(lái)了個(gè)大調換，卻缺乏在野斗爭經(jīng)驗，策略呆板、薄弱，沒(méi)有因身份的轉換而變得主動(dòng)，面對執政的民進(jìn)黨，顯得束手無(wú)策，仍處處被動(dòng)挨打，遭民進(jìn)黨“抄家滅族”式追殺，處境艱困，吳敦義上臺伊始，即面臨黨工薪資發(fā)放難題。對執政黨的監督、制衡乏力，民進(jìn)黨欲通過(guò)的眾多法案幾乎是暢通無(wú)阻。國民黨與親民黨、新黨的關(guān)系不睦，雖有心修復，卻無(wú)明顯成效，常常成為政壇孤家寡人，十分被動(dòng)。

　  上述困境仍嚴重制約著(zhù)國民黨的發(fā)展，阻礙其東山再起。